日本的建筑基本都是木制，火借风势，向整座城蔓延，胜海舟见西乡隆盛手段如此激烈愤怒之余又无可奈何，这样的滔天大火不是人力能扑灭的，只能撤出城外。
幕府军中甲州的士兵看着眼前的大火，痛哭出声，还有到山林躲避的百姓，个个哭天抢地，这把火烧掉了他们的一切。
“八嘎，八嘎……西乡隆盛这个混蛋竟然敢毁城，那好，你们等着瞧！”胜海舟怒不可遏，就算在日本最激烈的战国时代，也没有人敢做出烧毁一座城池的举动，倒幕军的做法彻底将幕府军激怒了。
一场焚城烈火将立时五个月的甲州战事划下句号，两军隔着火海相望，仇火就如同眼前的烈火一般炽烈，也预示着接下来的战斗将更加残酷。
甲州城一战，倒幕军伤亡四万四千余人，幕府军伤亡三万六千余人，所消耗的物资无法计算，可谓两败俱伤。
然而，此战也是日本内战的转折点，倒幕军因为后方补给线被切断只能后退，还要必须对付新出现的敌人，而幕府方面虽然甲州城被毁，但战略目的已经达到，倒幕军气势已经不再，而且因为焚城的举动彻底得罪了甲州人，将背负骂名，所谓的“正义之师”将不复存在。
德川庆喜抓住这次机会大肆渲染倒幕军的残暴，并且从幕府的粮仓拨出粮食赈济甲州百姓，让他赢得了更多的支持，尤其是甲州人，青年男子纷纷加入幕府军，准备为家园报仇雪恨。
西乡隆盛等人已经顾不得这些了，他们转头开始攻打骏河藩，骏河藩得到了幕府的军火支持，据城而守，倒幕军补给出现危机，再加上胜海舟率军尾随，他们只好撤出骏河，然而路上又遭到尾沪藩的进攻，尾沪是“三卿家”之一，和德川庆喜关系密切，本来在倒幕运动中保持中立，但幕府军势力越来越稳固，终于选择了站队，并作出了投名状。
西乡隆盛接连遭受打击，而且周围的藩国也开始摇摆，他只能率军退回京都，准备重整旗鼓。
幕府的防守战略获得成功，德川庆喜不在隐忍，他派出了手上最后一支生力军，命令松平容保率领两万新军支援胜海舟，六万大军直指京都。
京都天皇御所，昔日的倒幕盛况已经不再，现在支持天皇的只剩下以四强藩为主的关西诸藩，形势可谓急转直下。
“诸位，眼前形势危急，幕府大军直指京都，而我们可战之兵只有三万，可要如何应对！”明治天皇开口问道，他非常焦急，本来对未来的一切都已经规划完毕，只等着击败幕府就可以实施，没想到幕府竟然起死回生，他们反而处于不利地位。
这时，炽仁亲王说道：“天皇陛下，幕府之所以有此实力全是中华帝国在身后支持，据密探汇报幕府军中甚至有不少的中华军官指挥，粮食、军火源源不断输送到江户，才让幕府没有后顾之忧。臣认为应该和中华帝国谈判，许以好处，哪怕争取他们保持中立也好！”
“亲王殿下，此事不妥，幕府承诺的是成为中华帝国的藩属国，我们就算给他们再多的好处也不可能超过这一条。还有，据说德川庆喜将妹妹送给中华皇帝，还被册封为贵妃，如此关系我们根本打不破、我认为眼下的路只有一条，就是请英国人出兵，保住京都！”
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